Základní organizační struktura Správy

1) Ředitel - RNDr. Jaroslav Hromas, CV

2) Oddělení sekretariátu ředitele - Ing. Daniela Bílková, vedoucí

3) Referát závodního

4) Odbor ekonomicko-provozní 

     Ekonomicko-provozní náměstek - Ing. Lubomír Přibyl

• referát plánu a rozpočtu,
• referát personální práce.
• oddělení účetnictví,
• oddělení technické,

5) Oddělení péče o jeskyně (Blansko, Praha, Bozkov).

     Odborný náměstek - Ing. Karel Drbal, CV

6) Správy jeskyní

Správa Bozkovských dolomitových jeskyní (Bozkov),

Správa Koněpruských jeskyní (Koněprusy),

Správa Chýnovské jeskyně (Dolní Hořice),

Správa Jeskyně Na Špičáku (Supíkovice),

Správa Jeskyní Na Pomezí (Vápenná),

Správa Zbrašovských aragonitových jeskyní (Teplice nad Bečvou),

Správa Mladečských jeskyní (Mladeč),

Správa Javoříčských jeskyní (Javoříčko),

Správa Jeskyně Na Turoldu (Mikulov),

Správa jeskyní Moravského krasu (Blansko) s odděleními:

• ekonomické,
• technické,
• informační služba,
• provoz Punkevních jeskyní,
• provoz Kateřinské jeskyně,
• provoz Jeskyně Balcarka,
• provoz Sloupsko-šošůvských jeskyní,
• provoz jeskyně Výpustek.